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《传染病信息学—公共卫生症侯群监测与生物防御》
作者:(美)陈炘钧 等主编,宋宏彬 等主译
出版社:科学出版社 出版日期:2011/6/1
ISBN:9787030311740 定价: 58.00元
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    《传染病信息学--公共卫生症候群监测与生物防御(中文翻译版)》由HsinchunChen、Daniel Zeng PingYan所著,主要分为两部分,前一部分是对症状监测系统的功能、组成以及相关的算法做了详细的说明,后一部分则是用实例给我们展示目前世界上较好的几个症状监测系统。对于解决全球范围内重大传染病疫情监测具有重要意义。该书以信息驱动的观点(例如,信息系统设计,数据标准,生物监控算法,可视化计算方面的信息和系统评估),具有很强的信息技术,并且能为从事这个领域或者对这个领域感兴趣的人提供最新进展的概述,这本书以多学科的角度阐述相关内容,来满足不同背景工作人员的需要,促进跨学科的发展。该书还为公共卫生从业人员提供相关的比较研究,并提供具体的见解,可以帮助未来的症状监测系统的开发和实施,具有很强的实用性,可供公共保健、计算机科学、信息系统、软件工程、公共管理、政策及地理信息系统等人员阅读。

    内容推荐

    突发传染病疫情的早期发现和快速应急响应是公共卫生的第一要务,它推动了多学科交叉的新兴学科——传染病信息学的出现。《传染病信息学--公共卫生症候群监测与生物防御(中文翻译版)》由HsinchunChen、Daniel Zeng PingYan所著,对现有的症候群监测系统在统一框架下进行分析和评估,系统梳理症候群监测中所涉及的各类计算分析模型和疫情暴发的预测、预警技术,并对当前的研究进展进行综述和梳理。

    《传染病信息学--公共卫生症候群监测与生物防御(中文翻译版)》内容的视角具有多学科性,并结合具体案例来讨论应用方案,能够满足不同背景研究者的需要,可为公共卫生决策者和相关疾病控制专业人员提供帮助。

    目录

    第一部分 症候群监测系统

    第1章 传染病信息学概述

    第2章 公众卫生症候群监测系统

    第3章 症候群监测数据源和数据收集策略

    第4章 数据分析和暴发监测

    第5章 数据的可视化、疫情通报及预警

    第6章 系统评估与评价

    第二部分 症候群监测系统案例研究

    第7章 BioSense

    第8章 RODS

    第9章 BioPortal

    第10章 EssENCE

    第11章 纽约市症候群监测系统

    第12章 EARS

    第13章 ARGUS

    第14章 HEALTHMAP

    第15章 挑战和未来发展方向

    参考文献

    彩图

    在线试读部分章节

    第 一 部 分 症 候 群 监 测 系 统

    第 1 ~ 6 章主要从系统 、算法设计角度来详细讨论症候群监测系统 。 第 1 章总结了

    症候群监测的基本概念和主要目标 ,同时讨论了症候群监测系统开发和应用中面临的

    一些挑战 。 第 2 章提出了一个统一的概念性框架 ,用来对现有症候群监测系统的数据

    源 、采集策略 、数据分析 、疫情监测 、数据可视化 、疫情通报和预警等重要环节进行分析

    和总结 。 第 3 ~ 5 章则分别介绍了症候群监测系统中的各个组成部分 。 第 6 章根据症

    候群监测系统的相关文献 ,对各个系统进行了评价 ,并阐述了相关的政策性问题 。

    第 1 章 传染病信息学概述

    症候群监测是指对公共卫生相关信息进行连续监测 ,以尽可能快速和准确地发现传染

    病暴发 。 症候群监测系统在实践中正得到越来越广泛的应用 ,以满足对自然发生或生物恐

    怖袭击造成的传染病疫情的有效预防 、发现和管理的迫切需要 。 症候群监测研究是多学科

    交叉融合的产物 ,近几年已引起广泛关注 。 本专著从信息科学和技术的角度 ,全面展示了症

    候群监测系统研究的现状和系统开发的应用效果 。 我们详细调研了 50 个在各个国家和地

    方部门实施的症候群监测系统 ,同时对 200 多篇该领域的学术出版物进行了综合分析 ,为读

    者介绍症候群监测系统中的技术挑战 、适用方法或解决方案 ,并详细阐述了系统在实践运用

    中的现状及软件系统架构 、数据收集和共享 、数据分析 、数据访问和可视化等关键环节 。 此

    外 ,基于案例研究 ,本书对几个已得到实际应用的症候群监测系统进行了详细而深入的比较

    分析 。 基于案例研究的目的是希望在实际应用背景下综合讨论症候群监测系统中的关键要

    素及其内涵 。 本书还简要介绍了一些非技术性的关键问题 ,包括数据共享政策 、系统评估和

    应用策略 。

    导言这一章主要介绍症候群监测的重要性 。

    当前 ,人们对由于自然灾害和生物恐怖袭击所引发的传染病威胁越来越关注 ,传染病一

    旦流行 ,将造成重大人员伤亡和巨大经济损失 。 传染病和流行病暴发的准备 、早期发现和及

    时响应是公共卫生领域的头等大事 ,这些研究能够推动新兴的多学科交叉研究 。 最近几年 ,连续暴发多起灾难性的公共卫生事件 ,对人类健康安全造成了巨大威胁 。 例如 ,起源于亚洲

    (Li 等 ,2004)并引发全球流行的严重急性呼吸系统综合征(SARS) ,东亚国家暴发的禽流感

    (NBII 2006 ;USDA 2006) 。 另外自 2001 年 10 月炭疽事件以来 ,便在全球各地不断出现生

    物恐怖主义威胁(Buehler 等 ,2003 ;Cronin ,2005 ;Siegrist ,1999) 。

    公共卫生监测已经实施了几十年 ,一直以来 ,它都是发现新发突发传染病暴发流行的不

    可或缺的重要方法 ,对传染病暴发的征兆信息的早期发现在提高疫情应急反应方面发挥了

    重要作用(Pinner 等 ,2003) 。 传统的传染病监测通常依赖于实验室诊断 ,比较耗时 ,费力 ,而法定传染病的报告往往迟缓且不完整 ,于是人们发展出了一种新的公共卫生监测系统 ,其

    具有显著提高传染病暴发监测能力的巨大潜能 。 这些新的计算机化的监测系统能够给医院

    及国家和地方卫生官员提供及时 、有效的疫情监测信息(Dembek 等 ,2005 ;Pavlin ,2003) ,并能实时或近乎实时地监测严重传染病流行和潜在生物恐怖袭击的相关因子的暴露情况 ,根据这些情况 ,警示人们是否应采取公共卫生的应急响应措施以应对有可能暴发的疫情流

    行 ,此类公共卫生监测方法通常被称为症候群监测 ,它主要通过持续 、系统地收集 、分析和解

    译“症候群”特征数据 ,从而达到尽可能早期和准确地发现公共卫生异常事件的目的 。

    症候群监测的基本设想在于特定的传染病一般具有特定的症候群 ,这些症候群可以通

    过某些方式被及时收集到 ,如护理记录 、药品销售 、学校旷课 、公司缺勤记录等 ,除了及早发

    现 、报告疾病外 ,症候群监测还提供了丰富的数据仓库 ,以及高度灵活的关于疫情态势和事

    件特征的信息交流系统 ,多个参与者还可以在症候群监测系统中同时提供不同地域 、不同来

    源的相互之间有关联的各类信息 ,以便对不断变化的疫情状况有一个更全面和清晰的认识 ,这对事件报告 、制定战略应对计划以及追踪事件受害者具有重大意义 。 从症候群监测数据

    获得的信息 ,还可以用于对分发药品 、疫苗接种计划和资源分配等疾病预防控制长期项目的

    规划 、实施和评估(Mostashari 和 Hartman ,2003) 。

    近年来 ,人们提出了多种症候群监测方法 。 根据美国 CDC 在 2003 年进行的研究

    (Buehler等 ,2003) ,在全美各地约有 100 多个部门已部署实施了症候群监测系统 ,尽管这些

    系统目标相似 ,但在系统架构 、信息处理和管理技术及异常检测算法方面均有所不同 ,并且

    其覆盖地域 、监测病种也不尽相同 。 我们认为目前迫切需要在统一的框架下 ,对现有的这些

    系统及相关疫情建模和监测数据的分析及评价进行深入研究 。 在当前这种情况下 ,提出此

    项研究作为最先进的症候群监测研究和实践 ,无疑将对正在从事症候群监测或对症候群监

    测感兴趣的研究和从业人员有所帮助 ;同时还将为公共卫生部门提供症候群监测系统的比

    较研究 ,并提供一些具体的见解和经验 ,这些对将来的症候群监测系统研发和实施都会有所

    帮助 。

    编写本书的目的旨在通过对现有的症候群监测系统的监测能力和有效性进行调查分

    析 ,对症候群监测研究现状与实践进行综述 ,为未来研究和具体的系统开发和实施提供意见

    和指导 。 本书内容在我们近期发表的综述论文(Yan 等 ,2008)基础上进行了大规模拓展 ,并

    与这一领域出版的一些综述性文献进行比较研究 (Bravata 等 ,2004 ; Lober 等 ,2002 ;

    Mandl 等 ,2004 ;Yan 等 ,2006) ,更加侧重于对症候群监测系统的技术构成进行论述 ,更加

    注重从信息科学和技术的角度提出相关的科学问题和解决之道 。

    撰写本书有以下几个目的 :① 对现有系统实施效果和症候群监测技术的最新进展进行

    综述 ;② 明确新的需求及面临的挑战 ;③ 以综合的方式 ,从公共卫生行政业务 、公共卫生研究

    及信息科学三个方面评价系统及其实施效果 ;④ 为那些对症候群监测和传染病信息学这一

    新领域感兴趣的信息科学研究人员提供资讯 。 此书旨在帮助回答下列问题 :

    (1) 症候群监测对公共卫生监测问题是否是一种有效方法 ? 现有系统在多大程度上实

    现了早期预警 、疫情态势判断以及灵活应对 ? 怎样才能对可用性和有效性进行验证 ?

    (2) 什么样的信息共享 、疫情监测 、信息访问和可视化技术已得到实施 ? 这些技术是如

    何实现的 ? 这些方法在公共卫生领域的应用有何技术障碍 ?

    (3) 世界各国和地区对症候群监测系统的部署现状怎样 ? 是否存在法律或行政方面的

    因素阻碍了它们的广泛应用 ?

    本书分析了公共卫生症候群监测系统及相关疫情建模和监测方面的研究工作 ,着重介

    绍了将先进的信息技术应用到公共卫生监测方面的一些方法 ,主要集中于对美国公共卫生

    行政机构 、研究机构及相关产业在症候群监测方面所做的主要工作的调研 ,还包括其他具备

    较成熟的症候群监测实践的国家如加拿大 、英国 、澳大利亚 、日本和韩国等 。

    在撰写此书的过程中 ,我们检索了大约 250 本 1997 ~ 2008 年期间的出版物 。 为了明确

    相关的工作 ,搜索了《生物医学信息杂志》 、《美国医学信息协会杂志》 、《传染病监测进展杂

    志》 、《城市健康杂志》 、《人工智能的医学应用杂志》以及年度信息科学技术进展报告等期刊 、杂志及档案数据 ,这些杂志文章主要来自包括 PubMed 、Medline 、ScienceDirect 及Springer-

    Link 等网络数据库 。 检索时 ,不仅使用了常用的症候群监测关键词搜索词条如“症候群监

    测”和“生物监控” ,还使用了与症候群监测有关的各个技术方面的关键词词条 ,例如“疾病暴

    发识别” 、“空间监测”和“生物恐怖应急准备” 。 此外 ,我们还调研了其他研究网点 ,包括各种

    学会和研究小组的介绍材料和会议材料(例如 ,2006 年 、2007 年和 2008 年的亚利桑那生物

    监控研讨会 ,罗格斯 DIMACS 生物监控数据监测和信息交流工作组) ,并对从互联网上(例

    如 ,从国家/州卫生部门的网站)获取的应用系统的用户手册和系统手册进行了分析研究 。

    在此书中 ,我们主要对 50 多个症候群监测系统进行系统性研究 ,以使大家对症候群监

    测有一个较为全面的了解(编者注 :我们所做的调研没有重复计算一个系统在多个站点的应

    用) 。 我们调查的这些系统代表了大部分已知的症候群监测系统 ,这些系统的各种不同详尽

    程度的技术细节都是从开源渠道获得 。 每个系统的技术方法或解决方案都根据其应用目

    的 、输入假设及输出结果进行了详细分类和分析 ,这些技术之间的异同之处也都在本书中被

    指出和呈现 ,同时 ,还对它们之间的优缺点进行了总结 。 此外 ,本书还进行了一项跨系统的

    分析 ,它主要通过评估某一项特定技术在何种程度上可满足特定的症候群监测功能需求来

    实现 。

    我们对公共卫生症候群监测系统的论述主要基于一个概念框架(图 1-1) 。 一般而言 ,症候群监测由三个主要功能区组成 :数据源和数据收集 、数据分析和暴发发现 ,以及数据可

    视化和疫情通报 。 大多数目前正在实施的症候群监测系统均可囊括在下面这个框架体系

    里面 。

    图 1-1 症候群监测系统的体系结构

    书中首先关注的是在何处及如何收集数据 ,相关问题包括数据输入方法 、数据共享协议

    和传输技术 ;第二步涉及计算建模 、分析及用来监测数据异常和发现这些异常数据是否由疾

    病真实的内在变化引起的数据挖掘技术 ,症候群的分类过程是出现在数据收集和异常识别

    之间的关键步骤 ,其重点是对原始数据进行分类 ,将观测数据归入不同的症候群组 ,以便提

    炼一个衡量是否存在传染病暴发的适当尺度 ,为此尺度提供一种有意义的说明 ,并通过这一

    尺度判别任何目标疾病的异常情况 ;第三步包括数据可视化 、用户界面和信息发布功能 。 公

    共卫生官员 、流行病学家 、应急响应人员和国土安全部人员在需要时均可利用症候群监测系

    统实现互通和交流 ,通过症候群监测系统的某些功能获取详细信息 ,用于更进一步的调查 、情况预测分析及做出预警等级和传播 、扩散程度的判定 ,相关人员能够获取应急响应计划制

    定和事件管理所需的各类信息 。

    全书由两大部分组成 。 第一部分 ,从第 2 章到第 6 章 ,按照上述框架主要讨论症候群监

    测系统和技术的各项组成部分 ;第二部分 ,从第 7 章到第 14 章 ,主要基于代表性的系统和典

    型的应用场景综合介绍和对比案例应用情况 。

    最后一章是总结 ,概要介绍每个章节的主要功能并进行总结 。 在第 2 章 ,概要介绍了我

    们调查研究的症候群监测系统 ,其中大多数系统已在实际工作中应用 ;第 3 、4 和第 5 章分别

    讨论了有关数据收集 、数据分析 、疫情识别 、数据可视化和信息传递的技术方法 ;系统评估以

    及其他政策相关事宜主要在第 6 章讨论 。

    在从第 7 章到第 14 章的每一章中 ,我们分别展示了一个特定的症候群监测系统的案例

    研究 ,包括 BioSense 、RODS 、BioPortal 、ESSENCE 、NYC SS 、EARS 、Argus 和HealthMap

    系统 ;